八十年的研究尚未解开珍珠如何获得其颜色之谜。猜测有几个因素：产生珍珠的牡蛎种类，养殖珍珠的时间长度，养殖珍珠时的水温，甚至还有收获珍珠的季节。在从蚌壳中取出珍珠之前，没有办法准确预告珍珠的颜色。一个被植入了不同珠核的牡蛎可能产生五个不同颜色的珍珠。科学家尚不能完全明白为什么。牡蛎能生产出几乎各种颜色的珍珠。我们提到珍珠颜色时，特指体色，即珍珠的潜在基色。标准的颜色从黑色塔希提珠，到奶白色的阿古屋珠，到银白色的南海珠。但如果仔细检查上述任何一种珍珠，你会发现其它颜色，即在珍珠表面上反射的折光色。塔希提黑珍珠具有从柔和银灰色到深乌黑色的色调，在这些颜色范围内你会发现粉红、紫色甚至绿色的折光色。珍珠的折光色常常稍带粉红、银色或兰色。黑珍珠的折光色大多数为绿色或粉红色。珍珠颜色常常用体色和折光色的组合来描述。例如，白玫瑰色说明带玫瑰折光色的白珍珠。杂色珍珠（非白色的珍珠，例如黑珍珠）的评价还有第三个标准：色调。珍珠的色调说明杂色珍珠的明暗度并按浅至深的尺度分级。

　　对珍珠颜色和色调的喜好，各人各地不同。带有玫瑰折光色的粉红色和白色珍珠在美国和日本很流行。在法国，人们喜爱奶白色。在南美和西班牙，人们渴望黄色和金色的。肤色与这种喜好很有关系。

　　一种颜色并不比其它颜色高贵，但某种颜色的需求和稀缺性影响了它们的价格。即使这样，颜色只占珍珠价值的10%。玫瑰红色的珍珠需求一直很大，因此，它们经常比奶白色或金色的珍珠要贵。南海黑珍珠常常价格很高，它们要比传统的粉红色阿古屋珍珠卖价要高。