一般地说，功能性低聚糖可以从天然原料中直接提取， 如从大豆里提取的大豆低聚糖，从天然野生植物DP一1或生地或泽兰中提取的水苏糖等。此外，还可以利用转移酶、水解酶、糖苷转移酶等反应来制备，或利用酶水解法，或利用酸碱转化法，或进行化学合成等来制备。